В регионах осуществляется программа с участием Фонда развития территорий, благодаря которой обновляются устаревшая инфраструктура и сетевое хозяйство. С 2023 года по поручению Президента РФ в стране стартовала новая масштабная программа модернизации с участием средств федерального бюджета.
Фонд контролирует процесс восстановления прав людей - с момента принятия решения по проблемному объекту и до получения дольщиком квартиры или денежной компенсации.
Фонд участвует в ремонте теплотрасс, систем водоснабжения и водоотведения на территории новых регионов. Кроме того, организация является оператором программы по предоставлению жилищных сертификатов и единовременной выплаты гражданам, которые вынуждено покинули место постоянного проживания в городе Херсоне или части Херсонской области.